Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms