Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms