Protein–RNA interactions for Protein: Q00887

PSG9, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 9, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG9Q00887 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG9Q00887 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSG9Q00887 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms