Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCCQ00597 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCCQ00597 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms