Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNAQ00169 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms