Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms