Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPM4P67936 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM4P67936 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM4P67936 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM4P67936 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM4P67936 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM4P67936 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM4P67936 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM4P67936 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM4P67936 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPM4P67936 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPM4P67936 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM4P67936 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM4P67936 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM4P67936 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM4P67936 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM4P67936 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM4P67936 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM4P67936 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms