Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPEP62304 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms