Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFRD-1P60508 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms