Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DCDC1P59894 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCDC1P59894 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCDC1P59894 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DCDC1P59894 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms