Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms