Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EEFSECP57772 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms