Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAG2P55895 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAG2P55895 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAG2P55895 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAG2P55895 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAG2P55895 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAG2P55895 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAG2P55895 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAG2P55895 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAG2P55895 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAG2P55895 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAG2P55895 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAG2P55895 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAG2P55895 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAG2P55895 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAG2P55895 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAG2P55895 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAG2P55895 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAG2P55895 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAG2P55895 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAG2P55895 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAG2P55895 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAG2P55895 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAG2P55895 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAG2P55895 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAG2P55895 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAG2P55895 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms