Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL23P55773 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL23P55773 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL23P55773 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL23P55773 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL23P55773 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL23P55773 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL23P55773 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL23P55773 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL23P55773 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL23P55773 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL23P55773 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL23P55773 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL23P55773 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCL23P55773 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL23P55773 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL23P55773 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL23P55773 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL23P55773 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL23P55773 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL23P55773 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL23P55773 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL23P55773 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL23P55773 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL23P55773 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms