Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAD23AP54725 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD23AP54725 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms