Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	CDC5	YMR001C	2118 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	RLP7	YNL002C	969 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	RPA43	YOR340C	981 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	ENP2	YGR145W	2124 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	EBS1	YDR206W	2655 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	FLO5	YHR211W	3228 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	TSC11	YER093C	4293 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	CWC2	YDL209C	1020 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	COB	Q0105	1158 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	STE2	YFL026W	1296 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	COG7	YGL005C	840 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	MIG2	YGL209W	1149 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	NNF1	YJR112W	606 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YKL065W-A	YKL065W-A	222 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	NDL1	YLR254C	570 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	RPN13	YLR421C	471 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YNL276C	YNL276C	396 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YOR203W	YOR203W	354 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YBR287W	YBR287W	1284 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	VPS9	YML097C	1356 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	SEC27	YGL137W	2670 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	NDC80	YIL144W	2076 nt		3.2	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	VTC4	YJL012C	2166 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	CHS2	YBR038W	2892 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	ATP25	YMR098C	1839 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	GPI13	YLL031C	3054 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	ATC1	YDR184C	885 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	EST3	YIL009C-A	546 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YJL032W	YJL032W	315 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	GPX1	YKL026C	504 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	ECM4	YKR076W	1113 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	BET5	YML077W	480 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	SME1	YOR159C	285 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	TAZ1	YPR140W	1146 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	CBP6	YBR120C	489 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	MRH4	YGL064C	1686 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YGR237C	YGR237C	2358 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	REC8	YPR007C	2043 nt		3.19	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	ERP3	YDL018C	678 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	MFA1	YDR461W	111 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YEA4	YEL004W	1029 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	MAM1	YER106W	909 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	SPT2	YER161C	1002 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	UPF3	YGR072W	1164 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	AIM25	YJR100C	984 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YPT6	YLR262C	648 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YNL050C	YNL050C	813 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YNR062C	YNR062C	984 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	POL30	YBR088C	777 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	PUF6	YDR496C	1971 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	STD1	YOR047C	1335 nt		3.18	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	ARP4	YJL081C	1470 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	SEC4	YFL005W	648 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	Q0144	Q0144	330 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	NNT1	YLR285W	786 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	MGE1	YOR232W	687 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	snR189	snR189	189 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	RPL19A	YBR084C-A	570 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YBR090C	YBR090C	369 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	TOM1	YDR457W	9807 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	KRE2	YDR483W	1329 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	VPS38	YLR360W	1320 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	ESA1	YOR244W	1338 nt		3.17	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YHR080C	YHR080C	4038 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	PIG2	YIL045W	1617 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YJL049W	YJL049W	1353 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	ITT1	YML068W	1395 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	DNM1	YLL001W	2274 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	VIP1	YLR410W	3441 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	NKP1	YDR383C	717 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	BRR6	YGL247W	594 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	MRPL9	YGR220C	810 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	LIP2	YLR239C	987 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	SUB1	YMR039C	879 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	AAR2	YBL074C	1068 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	TPT1	YOL102C	693 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	MCA1	YOR197W	1299 nt		3.16	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YDL176W	YDL176W	2127 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	AI3	Q0060	1248 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	HTA1	YDR225W	399 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	OTU1	YFL044C	906 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RPL30	YGL030W	318 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YHL002C-A	YHL002C-A	489 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	PAU13	YHL046C	363 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YHL048C-A	YHL048C-A	135 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	MRPL20	YKR085C	588 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YLR050C	YLR050C	486 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	HMX1	YLR205C	954 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	SSN8	YNL025C	972 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	PEX27	YOR193W	1131 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	snR24	snR24	89 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	KAR4	YCL055W	1008 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	UBP8	YMR223W	1416 nt		3.15	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	SLH1	YGR271W	5904 nt		3.14	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YPD1	YDL235C	504 nt		3.14	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	GRX2	YDR513W	432 nt		3.14	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		3.14	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RPL1B	YGL135W	654 nt		3.14	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	SEC14	YMR079W	915 nt		3.14	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	GOT1	YMR292W	417 nt		3.14	□□□□□ -1.91

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