Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOSBP53539 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOSBP53539 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOSBP53539 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOSBP53539 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOSBP53539 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOSBP53539 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FOSBP53539 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOSBP53539 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOSBP53539 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOSBP53539 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOSBP53539 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOSBP53539 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOSBP53539 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOSBP53539 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FOSBP53539 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOSBP53539 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOSBP53539 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOSBP53539 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOSBP53539 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOSBP53539 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOSBP53539 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms