Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKX2-5P52952 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms