Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA4P52798 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA4P52798 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms