Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF138P52744 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms