Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA1P52294 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA1P52294 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA1P52294 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA1P52294 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA1P52294 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA1P52294 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms