Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK7P50613 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK7P50613 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK7P50613 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK7P50613 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK7P50613 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK7P50613 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK7P50613 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK7P50613 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK7P50613 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK7P50613 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK7P50613 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK7P50613 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK7P50613 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK7P50613 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK7P50613 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK7P50613 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK7P50613 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK7P50613 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK7P50613 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK7P50613 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK7P50613 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK7P50613 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK7P50613 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK7P50613 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK7P50613 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK7P50613 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK7P50613 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK7P50613 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK7P50613 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK7P50613 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK7P50613 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms