Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX5P50542 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX5P50542 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX5P50542 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX5P50542 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX5P50542 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX5P50542 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX5P50542 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX5P50542 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX5P50542 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX5P50542 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX5P50542 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX5P50542 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX5P50542 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX5P50542 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX5P50542 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX5P50542 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX5P50542 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX5P50542 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX5P50542 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX5P50542 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX5P50542 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX5P50542 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX5P50542 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX5P50542 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX5P50542 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX5P50542 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX5P50542 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX5P50542 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX5P50542 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX5P50542 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX5P50542 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX5P50542 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX5P50542 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX5P50542 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX5P50542 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX5P50542 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX5P50542 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX5P50542 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEX5P50542 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms