Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GSK3BP49841 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GSK3BP49841 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms