Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC2P49815 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC2P49815 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC2P49815 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSC2P49815 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSC2P49815 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSC2P49815 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSC2P49815 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSC2P49815 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC2P49815 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC2P49815 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC2P49815 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC2P49815 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC2P49815 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC2P49815 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC2P49815 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC2P49815 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC2P49815 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC2P49815 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC2P49815 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC2P49815 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC2P49815 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms