Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFMP49411 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFMP49411 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFMP49411 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFMP49411 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFMP49411 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFMP49411 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFMP49411 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFMP49411 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFMP49411 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUFMP49411 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFMP49411 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFMP49411 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFMP49411 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFMP49411 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFMP49411 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFMP49411 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFMP49411 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFMP49411 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFMP49411 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFMP49411 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUFMP49411 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUFMP49411 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFMP49411 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFMP49411 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFMP49411 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFMP49411 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUFMP49411 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUFMP49411 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUFMP49411 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUFMP49411 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFMP49411 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFMP49411 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFMP49411 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFMP49411 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFMP49411 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUFMP49411 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms