Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms