Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD97P48960 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD97P48960 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD97P48960 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD97P48960 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD97P48960 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD97P48960 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD97P48960 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD97P48960 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD97P48960 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD97P48960 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD97P48960 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD97P48960 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD97P48960 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD97P48960 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD97P48960 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD97P48960 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD97P48960 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD97P48960 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD97P48960 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD97P48960 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD97P48960 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD97P48960 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD97P48960 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD97P48960 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD97P48960 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD97P48960 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD97P48960 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD97P48960 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD97P48960 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD97P48960 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD97P48960 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD97P48960 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD97P48960 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD97P48960 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD97P48960 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD97P48960 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD97P48960 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD97P48960 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.2 ms