Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSMD8P48556 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD8P48556 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms