Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD4P46934 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4P46934 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms