Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACADSBP45954 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACADSBP45954 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms