Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPD2P43304 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPD2P43304 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPD2P43304 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPD2P43304 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPD2P43304 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPD2P43304 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPD2P43304 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPD2P43304 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPD2P43304 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPD2P43304 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPD2P43304 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPD2P43304 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPD2P43304 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPD2P43304 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPD2P43304 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPD2P43304 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPD2P43304 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPD2P43304 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPD2P43304 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPD2P43304 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPD2P43304 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPD2P43304 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPD2P43304 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPD2P43304 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPD2P43304 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPD2P43304 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPD2P43304 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPD2P43304 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPD2P43304 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPD2P43304 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPD2P43304 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPD2P43304 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms