Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms