Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPOP42166 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMPOP42166 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMPOP42166 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMPOP42166 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMPOP42166 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPOP42166 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPOP42166 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPOP42166 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPOP42166 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMPOP42166 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms