Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
POLR2IP36954 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms