Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms