Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPB2P35606 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPB2P35606 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPB2P35606 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPB2P35606 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPB2P35606 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPB2P35606 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPB2P35606 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPB2P35606 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPB2P35606 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPB2P35606 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPB2P35606 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COPB2P35606 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPB2P35606 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPB2P35606 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPB2P35606 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COPB2P35606 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPB2P35606 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COPB2P35606 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPB2P35606 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPB2P35606 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPB2P35606 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPB2P35606 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPB2P35606 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPB2P35606 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPB2P35606 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COPB2P35606 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPB2P35606 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPB2P35606 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPB2P35606 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPB2P35606 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPB2P35606 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPB2P35606 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPB2P35606 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COPB2P35606 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPB2P35606 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COPB2P35606 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPB2P35606 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPB2P35606 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPB2P35606 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPB2P35606 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPB2P35606 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPB2P35606 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPB2P35606 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms