Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASQ1P31415 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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