Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms