Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCND3P30281 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCND3P30281 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCND3P30281 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCND3P30281 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCND3P30281 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCND3P30281 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCND3P30281 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCND3P30281 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND3P30281 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND3P30281 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND3P30281 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND3P30281 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND3P30281 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND3P30281 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND3P30281 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND3P30281 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND3P30281 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND3P30281 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND3P30281 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND3P30281 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND3P30281 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND3P30281 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND3P30281 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND3P30281 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND3P30281 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms