Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC27P30260 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC27P30260 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC27P30260 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC27P30260 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC27P30260 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC27P30260 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC27P30260 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC27P30260 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC27P30260 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC27P30260 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC27P30260 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC27P30260 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC27P30260 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC27P30260 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms