Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms