Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB2P29033 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB2P29033 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB2P29033 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB2P29033 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB2P29033 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB2P29033 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB2P29033 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB2P29033 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB2P29033 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB2P29033 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB2P29033 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB2P29033 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB2P29033 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB2P29033 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB2P29033 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB2P29033 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB2P29033 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB2P29033 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB2P29033 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB2P29033 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB2P29033 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB2P29033 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB2P29033 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB2P29033 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB2P29033 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB2P29033 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB2P29033 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB2P29033 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB2P29033 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB2P29033 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB2P29033 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB2P29033 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB2P29033 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB2P29033 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms