Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF8P28908 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF8P28908 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF8P28908 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF8P28908 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF8P28908 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF8P28908 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF8P28908 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF8P28908 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF8P28908 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms