Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTX3P26022 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTX3P26022 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTX3P26022 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTX3P26022 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms