Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA4P25789 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms