Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B4P23634 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms