Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGA6P23229 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms