Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT1P21579 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT1P21579 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT1P21579 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT1P21579 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT1P21579 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT1P21579 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT1P21579 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT1P21579 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT1P21579 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT1P21579 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT1P21579 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT1P21579 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYT1P21579 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT1P21579 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT1P21579 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYT1P21579 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT1P21579 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms