Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms